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“万种鸟类基因组计划”旨在构建所有现生鸟类基因组图谱，从全基因组水平构建所有现生鸟类物种的生命之树，揭示整个鸟纲物种的种群变化历史。

该计划由浙江大学生命演化研究中心张国捷教授联合丹麦哥本哈根大学、美国洛克菲勒大学、中国科学院动物研究所，以及深圳华大生命科学研究院和国内外多个自然历史博物馆、研究中心共同发起的国际联合攻关项目。

2020年，项目研究团队通过建立不依赖参考基因组的全基因组序列比对方法，构建了363种鸟类全基因组同源序列，覆盖了92%的现生鸟类科阶元，为解析鸟类“科”级别系统发育关系提供了可能。